Las enfermedades de plantas son uno de los factores más  de la producción en diferentes cultivos a nivel mundial, nacional y regional, lo cual hace importante el manejo de las patologías y patógenos asociados a las mismas para efecto de reducir las pérdidas en producción. El manejo de enfermedades implica regular las poblaciones de patógenos haciendo uso de diferentes estrategias de control, las cuales se pueden enmarcar dentro de lo que se denomina MIE (Manejo Integrado de Enfermedades).
El núcleo de la asignatura se encuentra en 8 unidades: 1. Concepto de Manejo Integrado de Enfermedades, 2. Evaluación de enfermedades y pérdidas, 3. Control legal, 4. Control genético, 5. Control cultural, 6. Control físico, 7. Control biológico, y 8. Control químico.